數(shù)據(jù)挖掘—miRNA調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建資源簡(jiǎn)介
由于人類(lèi)的基因數(shù)量巨大,miRNA作為調(diào)控這些基因表達(dá)的非編碼RNA,其與基因的關(guān)系非常復(fù)雜。當(dāng)前基因樣本數(shù)目高達(dá)兩萬(wàn)多維,隨著維數(shù)的增加,獲取基因與miRNA之間的關(guān)系的難度也隨之增加。近年來(lái)關(guān)于基因和miRNA之間關(guān)系的研究成為生物信息學(xué)的一個(gè)熱點(diǎn)。研究者們發(fā)現(xiàn)眾多疾病間存在很多共性,比如某些基因和miRNA在多種疾病中都有相似的表達(dá),需要通過(guò)一定方法識(shí)別這些疾病中相關(guān)的miRNA和基因的調(diào)控關(guān)系。目前建立兩者的調(diào)控關(guān)系方法有很多，包括數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)，算法的運(yùn)用，實(shí)驗(yàn)的驗(yàn)證等等。這些都會(huì)通過(guò)詳細(xì)的介紹傳遞給大家。并會(huì)通過(guò)具體的操作向大家演示如何構(gòu)建兩者的關(guān)系。相較于之前推出的《豪斯醫(yī)生基因數(shù)據(jù)挖掘》和《WGCNA詳解》，此次課程在內(nèi)容上進(jìn)行了延伸，將重點(diǎn)回到了非編碼RNA的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)上。這過(guò)程中，不僅會(huì)重新溫故之前的知識(shí)，又將WGCNA作為一種新的算法構(gòu)建miRNA與mRNA的關(guān)系。
具體地，你將進(jìn)一步了解非編碼RNA數(shù)據(jù)的下載和處理，WGCNA的理論和操作，數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì)，cytoscape的靈活玩轉(zhuǎn)，還有R語(yǔ)言的基本語(yǔ)法。該課程的學(xué)習(xí)會(huì)為大家在科研的道路中增加新的助力。
課程目錄
├──01、TCGA概述
| ├──01、TCGA概述.mp4 68.48M
| ├──02、TCGA概述.mp4 17.61M
| └──03、TCGA概述.mp4 37.08M
├──02、構(gòu)建調(diào)控關(guān)系理論
| ├──01、構(gòu)建調(diào)控關(guān)系理論.mp4 18.94M
| ├──02、構(gòu)建調(diào)控關(guān)系理論.mp4 66.52M
| └──03、構(gòu)建調(diào)控關(guān)系理論.mp4 141.73M
├──03、WGCNA理論
| ├──01、WGCNA理論.mp4 24.27M
| ├──02、WGCNA理論.mp4 18.90M
| ├──03、WGCNA理論.mp4 20.97M
| └──04、WGCNA理論.mp4 53.19M
├──04、數(shù)據(jù)下載
| ├──01、數(shù)據(jù)下載.mp4 55.22M
| ├──02、數(shù)據(jù)下載.mp4 52.12M
| ├──03、數(shù)據(jù)下載.mp4 47.11M
| └──04、數(shù)據(jù)下載.mp4 96.09M
├──05、提取蛋白編碼基因
| ├──01、提取蛋白編碼基因.mp4 64.98M
| ├──02、提取蛋白編碼基因.mp4 51.92M
| ├──03、提取蛋白編碼基因.mp4 56.89M
| ├──04、提取蛋白編碼基因.mp4 56.79M
| └──05、提取蛋白編碼基因.mp4 105.10M
├──06、差異分析
| ├──01、差異分析.mp4 52.20M
| ├──02、差異分析.mp4 41.62M
| └──03、差異分析.mp4 98.34M
├──07、基于算法構(gòu)建調(diào)控
| ├──01、基于算法構(gòu)建調(diào)控.mp4 64.70M
| ├──02、基于算法構(gòu)建調(diào)控.mp4 58.44M
| ├──03、基于算法構(gòu)建調(diào)控.mp4 54.62M
| └──04、基于算法構(gòu)建調(diào)控.mp4 64.92M
├──08、cytoscape構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)
| ├──01、cytoscape構(gòu)建網(wǎng)絡(luò).mp4 60.00M
| └──02、cytoscape構(gòu)建網(wǎng)絡(luò).mp4 105.75M
└──09、數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)
| ├──01、數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè).mp4 47.45M
| ├──02、數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè).mp4 272.25M
| ├──03、數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè).mp4 44.58M
| └──04、數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè).mp4 96.81M
